Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTTP42858 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTTP42858 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTTP42858 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HTTP42858 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTTP42858 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTTP42858 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTTP42858 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTTP42858 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTTP42858 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTTP42858 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTTP42858 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTTP42858 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTTP42858 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTTP42858 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTTP42858 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTTP42858 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTTP42858 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HTTP42858 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HTTP42858 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTTP42858 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTTP42858 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTTP42858 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTTP42858 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTTP42858 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTTP42858 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTTP42858 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTTP42858 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTTP42858 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTTP42858 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTTP42858 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTTP42858 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTTP42858 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTTP42858 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTTP42858 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTTP42858 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTTP42858 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTTP42858 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTTP42858 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTTP42858 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTTP42858 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTTP42858 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTTP42858 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTTP42858 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HTTP42858 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTTP42858 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HTTP42858 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HTTP42858 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTTP42858 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTTP42858 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HTTP42858 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HTTP42858 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HTTP42858 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HTTP42858 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTTP42858 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTTP42858 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTTP42858 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTTP42858 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTTP42858 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTTP42858 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTTP42858 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HTTP42858 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HTTP42858 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTTP42858 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTTP42858 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTTP42858 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTTP42858 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTTP42858 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTTP42858 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTTP42858 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTTP42858 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTTP42858 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTTP42858 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTTP42858 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms