Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA2P24043 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA2P24043 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA2P24043 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms