Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPREP23469 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPREP23469 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPREP23469 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPREP23469 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPREP23469 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPREP23469 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPREP23469 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPREP23469 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPREP23469 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPREP23469 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPREP23469 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPREP23469 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPREP23469 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPREP23469 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPREP23469 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPREP23469 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPREP23469 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPREP23469 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPREP23469 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPREP23469 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPREP23469 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPREP23469 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPREP23469 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPREP23469 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPREP23469 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPREP23469 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPREP23469 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPREP23469 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPREP23469 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPREP23469 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPREP23469 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPREP23469 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPREP23469 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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