Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXA5P20719 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA5P20719 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms