Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms