Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN1P18031 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms