Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SELPP16109 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELPP16109 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELPP16109 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELPP16109 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELPP16109 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SELPP16109 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SELPP16109 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELPP16109 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELPP16109 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SELPP16109 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SELPP16109 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELPP16109 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELPP16109 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELPP16109 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELPP16109 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELPP16109 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SELPP16109 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELPP16109 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELPP16109 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELPP16109 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELPP16109 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELPP16109 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELPP16109 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELPP16109 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SELPP16109 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SELPP16109 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELPP16109 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELPP16109 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELPP16109 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELPP16109 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELPP16109 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELPP16109 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELPP16109 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SELPP16109 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELPP16109 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELPP16109 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELPP16109 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELPP16109 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELPP16109 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELPP16109 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELPP16109 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SELPP16109 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELPP16109 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELPP16109 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms