Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYOD1P15172 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms