Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1A3P13637 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms