Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCL3P10147 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCL3P10147 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCL3P10147 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL3P10147 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL3P10147 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL3P10147 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL3P10147 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL3P10147 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL3P10147 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL3P10147 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL3P10147 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCL3P10147 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCL3P10147 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCL3P10147 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCL3P10147 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCL3P10147 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCL3P10147 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3P10147 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3P10147 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3P10147 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3P10147 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3P10147 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3P10147 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3P10147 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3P10147 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3P10147 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3P10147 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL3P10147 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL3P10147 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL3P10147 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL3P10147 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL3P10147 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL3P10147 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3P10147 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3P10147 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3P10147 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL3P10147 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL3P10147 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL3P10147 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL3P10147 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms