Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM6P0DI80 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms