Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POP4O95707 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP4O95707 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP4O95707 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP4O95707 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP4O95707 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP4O95707 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP4O95707 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP4O95707 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP4O95707 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP4O95707 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP4O95707 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP4O95707 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP4O95707 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP4O95707 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP4O95707 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP4O95707 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP4O95707 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP4O95707 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP4O95707 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP4O95707 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP4O95707 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP4O95707 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP4O95707 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP4O95707 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP4O95707 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP4O95707 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP4O95707 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP4O95707 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP4O95707 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP4O95707 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP4O95707 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP4O95707 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP4O95707 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP4O95707 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP4O95707 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP4O95707 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP4O95707 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP4O95707 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP4O95707 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP4O95707 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP4O95707 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP4O95707 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POP4O95707 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP4O95707 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP4O95707 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP4O95707 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP4O95707 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP4O95707 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP4O95707 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP4O95707 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP4O95707 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP4O95707 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms