Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRATO95237 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRATO95237 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRATO95237 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRATO95237 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRATO95237 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRATO95237 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRATO95237 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRATO95237 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRATO95237 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRATO95237 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRATO95237 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRATO95237 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRATO95237 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRATO95237 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRATO95237 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRATO95237 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRATO95237 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRATO95237 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRATO95237 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRATO95237 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRATO95237 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRATO95237 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRATO95237 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRATO95237 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRATO95237 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRATO95237 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRATO95237 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms