Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPX2O60687 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPX2O60687 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms