Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT86O43790 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT86O43790 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT86O43790 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT86O43790 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT86O43790 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT86O43790 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT86O43790 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT86O43790 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT86O43790 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT86O43790 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT86O43790 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT86O43790 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT86O43790 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT86O43790 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT86O43790 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT86O43790 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT86O43790 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT86O43790 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT86O43790 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT86O43790 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT86O43790 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT86O43790 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT86O43790 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT86O43790 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT86O43790 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT86O43790 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT86O43790 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT86O43790 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT86O43790 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT86O43790 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT86O43790 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT86O43790 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT86O43790 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT86O43790 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT86O43790 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT86O43790 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT86O43790 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT86O43790 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT86O43790 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT86O43790 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT86O43790 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT86O43790 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT86O43790 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT86O43790 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT86O43790 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms