Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 HCFC1R1-204ENST00000573095 828 ntTSL 319.45■□□□□ 0.74e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PDP2-209ENST00000568869 598 ntTSL 419.03■□□□□ 0.644e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-17■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SBDS-202ENST00000414306 1531 ntTSL 518.6■□□□□ 0.576e-13■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SBDS-204ENST00000490953 841 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.566e-13■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 C19orf66-207ENST00000587710 808 ntTSL 518.42■□□□□ 0.547e-10■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 RNASEK-206ENST00000552321 739 ntTSL 217.98■□□□□ 0.473e-13■■■■■ 45.1
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DDX3XO00571 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.456e-13■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PDP2-206ENST00000566805 558 ntTSL 417.81■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 LAD1-206ENST00000631576 550 ntTSL 417.74■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.241e-32■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-11■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PDP2-203ENST00000561704 574 ntTSL 316.46■□□□□ 0.234e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.224e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-17■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 AL391244.1-204ENST00000576232 585 ntTSL 315.97■□□□□ 0.154e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.134e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 RALGDS-213ENST00000493438 4602 ntTSL 215.79■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PDP2-207ENST00000568398 362 ntTSL 415.78■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PDP2-208ENST00000568720 917 ntTSL 315.36■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 AL162258.1-203ENST00000472233 637 ntTSL 315.15■□□□□ 0.021e-27■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PAFAH1B3-206ENST00000597333 726 ntTSL 215.01□□□□□ -0.019e-15■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SPG21-204ENST00000557795 747 ntTSL 514.97□□□□□ -0.014e-11■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SPG21-206ENST00000558415 562 ntTSL 314.62□□□□□ -0.074e-11■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 BLOC1S2-201ENST00000361832 425 ntTSL 513.95□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-32■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 AL391244.1-205ENST00000570344 515 ntTSL 412.95□□□□□ -0.344e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PAFAH1B3-203ENST00000594989 649 ntTSL 512.32□□□□□ -0.444e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 YPEL5-203ENST00000379520 2560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PDP2-201ENST00000311765 7146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PDP2-204ENST00000566543 560 ntTSL 410.58□□□□□ -0.724e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 PDP2-205ENST00000566776 848 ntTSL 49.99□□□□□ -0.814e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.123e-11■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.264e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.454e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 YPEL5-208ENST00000490211 653 ntTSL 55.82□□□□□ -1.484e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 AL162258.1-202ENST00000484413 508 ntTSL 25.75□□□□□ -1.491e-27■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SPG21-208ENST00000558943 544 ntTSL 45.5□□□□□ -1.534e-11■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SPG21-212ENST00000560878 541 ntTSL 54.92□□□□□ -1.624e-11■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 ZNF518B-205ENST00000515072 2623 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.373e-8■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 ZNF518B-203ENST00000503068 4196 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 ZNF518B-204ENST00000507515 527 ntTSL 49.42□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 CAPN7-203ENST00000418994 781 ntTSL 526.81■■□□□ 1.883e-19■■■■■ 45
DDX3XO00571 CAPN7-205ENST00000457023 854 ntTSL 325.28■■□□□ 1.643e-19■■■■■ 45
DDX3XO00571 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.223e-19■■■■■ 45
DDX3XO00571 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-11■■■■■ 45
DDX3XO00571 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-11■■■■■ 45
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DDX3XO00571 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-11■■■■■ 45
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DDX3XO00571 PGPEP1-208ENST00000600283 1414 ntTSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 45
DDX3XO00571 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 45
DDX3XO00571 TCF19-201ENST00000376255 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 45
DDX3XO00571 TCF19-202ENST00000376257 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 45
DDX3XO00571 SLC2A10-203ENST00000611837 586 ntTSL 217.8■□□□□ 0.445e-13■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.345e-13■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.545e-14■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.045e-14■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.335e-28■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.079e-8■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 218.96■□□□□ 0.633e-31■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 44.9
DDX3XO00571 GDE1-203ENST00000564172 2238 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.618e-15■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.488e-15■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 RECQL-201ENST00000314748 1054 ntTSL 512.95□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 RECQL-205ENST00000536240 565 ntTSL 412.2□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 RECQL-206ENST00000536964 578 ntTSL 311.89□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 RECQL-202ENST00000396093 932 ntTSL 511.4□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 RECQL-208ENST00000542432 600 ntTSL 310.24□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 RECQL-207ENST00000539672 579 ntTSL 510.23□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.082e-8■■■■■ 44.8
DDX3XO00571 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.151e-21■■■■■ 44.7
DDX3XO00571 SLC39A6-201ENST00000269187 3543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.721e-18■■■■■ 44.6
DDX3XO00571 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-26■■■■■ 44.6
DDX3XO00571 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.21e-26■■■■■ 44.6
DDX3XO00571 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.729e-21■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.123e-10■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.033e-10■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.223e-10■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.336e-15■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.016e-15■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 SPG21-207ENST00000558765 624 ntTSL 38.36□□□□□ -1.073e-11■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 SURF2-203ENST00000495524 676 ntTSL 519.37■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 44.5
DDX3XO00571 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.98e-7■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 AKIRIN1-204ENST00000531822 718 ntTSL 58.53□□□□□ -1.045e-63■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.115e-14■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.991e-9■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.881e-9■■■■■ 44.4
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