Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS1O00470 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms