Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L12C9JPN9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L12C9JPN9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms