Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VGLL3A8MV65 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms