Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX2A6NKB5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms