Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEMP2A6NFY4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEMP2A6NFY4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms