Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPM1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PPM1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms