Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGSF9Q9P2J2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms