Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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