Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3GL2Q99962 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms