Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms