Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL15Q16663 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms