Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms