Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RLFQ13129 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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