Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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