Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
STX4Q12846 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
STX4Q12846 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
STX4Q12846 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
STX4Q12846 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
STX4Q12846 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
STX4Q12846 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
STX4Q12846 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
STX4Q12846 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
STX4Q12846 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
STX4Q12846 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms