Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPIBQ01892 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms