Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSCP56915 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSCP56915 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSCP56915 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms