Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GDF10P55107 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF10P55107 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GDF10P55107 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GDF10P55107 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF10P55107 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms