Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NESP48681 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NESP48681 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NESP48681 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NESP48681 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NESP48681 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NESP48681 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NESP48681 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms