Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms