Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms