Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RLBP1P12271 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms