Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms