Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms