Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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