Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZYG11BQ9C0D3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms