Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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GCNAQ96QF7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GCNAQ96QF7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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GCNAQ96QF7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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