Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NTRK3Q16288 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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NTRK3Q16288 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NTRK3Q16288 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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