Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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