Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE3BQ13370 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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