Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms