Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TULP3O75386 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TULP3O75386 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TULP3O75386 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TULP3O75386 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TULP3O75386 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TULP3O75386 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TULP3O75386 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TULP3O75386 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TULP3O75386 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms