Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms