Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms